| Mabashi | JR East | Joban line | Chiba pref. | 馬橋 | 千葉県 | |
| Machida | ODAKYU | Odawara line | Tokyo pref. | 町田 | 東京都 | |
| Machiya | Tokyo Metro | Chiyoda line | Arakawa ward | C-17 | 町屋 | 荒川区 |
| Machiya | KEISEI | Honsen line | Arakawa ward | KS04 | 町屋 | 荒川区 |
| Machiya-ekimae | TOEI | Arakawa line | Arakawa ward | 町屋駅前 | 荒川区 | |
| Machiya-nichome | TOEI | Arakawa line | Arakawa ward | 町谷二丁目 | 荒川区 | |
| Magome | TOEI | Asakusa line | Ota ward | A-02 | 馬込 | 大田区 |
| Maibara | JR Central | Tokaido shinkansen | Shiga pref. | 米原 | 滋賀県 | |
| Maihama | JR East | Keiyo line | Chiba pref. | 舞浜 | 千葉県 | |
| Makuhari | JR East | Sobu-chuo line | Chiba pref. | 幕張 | 千葉県 | |
| Makuhari-hongo | JR East | Sobu-chuo line | Chiba pref. | 幕張本郷 | 千葉県 | |
| Mamada | JR East | Tohoku line/Utsunomiya line | Tochigi pref. | 間々田 | 栃木県 | |
| Manazuru | JR East | Tokaido line | Kanagawa pref. | 真鶴 | 神奈川県 | |
| Matsubara | TOKYU | Setagaya line | Setagaya ward | SG09 | 松原 | 世田谷区 |
| Matsubara-danchi | TOBU | Isesaki line/Skytree line | Saitama pref. | TS-17 | 松原団地 | 埼玉県 |
| Matsudo | JR East | Joban line | Chiba pref. | 松戸 | 千葉県 | |
| Matsuhidai | HOKUSO | Hokuso line | Chiba pref. | HS06 | 松飛台 | 千葉県 |
| Meguro | JR East | Yamanote line | Shinagawa ward | 目黒 | 品川区 | |
| Meguro | TOEI | Mita line | Shinagawa ward | I-01 | 目黒 | 品川区 |
| Meguro | Tokyo Metro | Nanboku line | Shinagawa ward | N-01 | 目黒 | 品川区 |
| Meguro | TOKYU | Meguro line | Shinagawa ward | MG01 | 目黒 | 品川区 |
| Meidai-mae | KEIO | Keio line | Setagaya ward | KO06 | 明大前 | 世田谷区 |
| Meidai-mae | KEIO | Inokashira line | Setagaya ward | IN08 | 明大前 | 世田谷区 |
| Meiji-jingu-mae | Tokyo Metro | Chiyoda line | Shibuya ward | C-03 | 明治神宮前 | 渋谷区 |
| Meiji-jingu-mae | Tokyo Metro | Fukutoshin line | Shibuya ward | F-15 | 明治神宮前 | 渋谷区 |
| Mejiro | JR East | Yamanote line | Toshima ward | 目白 | 豊島区 | |
| Mejirodai | KEIO | Takao line | Tokyo pref. | KO50 | めじろ台 | 東京都 |
| Midoridai | KEISEI | Chiba line | Chiba pref. | KS56 | みどり台 | 千葉県 |
| Midorigaoka | TOKYU | Oimachi line | Meguro ward | OM09 | 緑ヶ丘 | 目黒区 |
| Midorino | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Ibaraki pref. | 17 | みどりの | 茨城県 |
| Mihara | JR West | Sanyo shinkansen | Hiroshima pref. | 三原 | 広島県 | |
| Mikawa-anjo | JR Central | Tokaido shinkansen | Aichi pref. | 三河安城 | 愛知県 | |
| Mikawashima | JR East | Joban line | Arakawa ward | 三河島 | 荒川区 | |
| Mimomi | KEISEI | Honsen line | Chiba pref. | KS28 | 実籾 | 千葉県 |
| Minami-asagaya | Tokyo Metro | Marunouchi line | Suginami ward | M-02 | 南阿佐ヶ谷 | 杉並区 |
| Minami-funabashi | JR East | Keiyo line | Chiba pref. | 南船橋 | 千葉県 | |
| Minami-funabashi | JR East | Musashino line | Chiba pref. | 南船橋 | 千葉県 | |
| Minami-furuya | JR East | Kawagoe line | Saitama pref. | 南古屋 | 埼玉県 | |
| Minami-gyotoku | Tokyo Metro | Tozai line | Chiba pref. | T-19 | 南行徳 | 千葉県 |
| Minami-hanyu | TOBU | Isesaki line | Saitama pref. | TI-06 | 南羽生 | 埼玉県 |
| Minami-hatogaya | Saitama-kosoku | Saitama-kosoku line | Saitama pref. | 南鳩ヶ谷 | 埼玉県 | |
| Minami-kashiwa | JR East | Joban line | Chiba pref. | 南柏 | 千葉県 | |
| Minami-koshigaya | JR East | Musashino line | Saitama pref. | 南越谷 | 埼玉県 | |
| Minami-machida Grandberry Park | TOKYU | Denen-toshi line | Tokyo pref. | DT25 | 南町田グランベリーパーク | 東京都 |
| Minami-nagareyama | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Chiba pref. | 10 | 南流山 | 千葉県 |
| Minami-nagareyama | JR East | Musashino line | Chiba pref. | 南流山 | 千葉県 | |
| Minami-osawa | KEIO | Sagamihara line | Tokyo pref. | KO43 | 南大沢 | 東京都 |
| Minami-ota | KEIKYU | Honsen line | Kanagawa pref. | KK41 | 南太田 | 神奈川県 |
| Minami-otsuka | SEIBU | Seibu-shinjuku line | Saitama pref. | SS28 | 南大塚 | 埼玉県 |
| Minami-rinkan | ODAKYU | Enoshima line | Kanagawa pref. | 南林間 | 神奈川県 | |
| Minami-senju | JR East | Joban line | Arakawa ward | 南千住 | 荒川区 | |
| Minami-senju | Tokyo Metro | Hibiya line | Arakawa ward | H-21 | 南千住 | 荒川区 |
| Minami-senju | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Arakawa ward | 04 | 南千住 | 荒川区 |
| Minami-shinjyuku | ODAKYU | Odawara line | Shibuya ward | 南新宿 | 渋谷区 | |
| Minami-sunamachi | Tokyo Metro | Tozai line | Koto ward | T-15 | 南砂町 | 江東区 |
| Minami-urawa | JR East | Keihin-tohoku line | Saitama pref. | 南浦和 | 埼玉県 | |
| Minami-urawa | JR East | Musashino line | Saitama pref. | 南浦和 | 埼玉県 | |
| Minami-yono | JR East | Saikyo line | Saitama pref. | 南与野 | 埼玉県 | |
| Minamidaira | KEIO | Keio line | Tokyo pref. | KO30 | 南平 | 東京都 |
| Minato-mirai | Minato-mirai | Minato-mirai line | Kanagawa pref. | MM03 | みなとみらい | 神奈川県 |
| Minatocho | KEIKYU | Daishi line | Kanagawa pref. | KK21 | 港町 | 神奈川県 |
| Minowa | Tokyo Metro | Hibiya line | Taito ward | H-20 | 三ノ輪 | 台東区 |
| Minowabashi | TOEI | Arakawa line | Arakawa ward | 三ノ輪橋 | 荒川区 | |
| Minumadai-shinsui-koen | TOEI | Nippori-Toneri liner | Adachi ward | 13 | 見沼代親水公園 | 足立区 |
| Miraidaira | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Ibaraki pref. | 16 | みらい平 | 茨城県 |
| Misaki-guchi | KEIKYU | Kurihama line | Kanagawa pref. | KK72 | 三崎口 | 神奈川県 |
| Misato | JR East | Musashino line | Saitama pref. | 三郷 | 埼玉県 | |
| Misato-chuo | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Saitama pref. | 09 | 三郷中央 | 埼玉県 |
| Mishima | JR Central | Tokaido shinkansen | Shizuoka pref. | 三島 | 静岡県 | |
| Mita | TOEI | Asakusa line | Minato ward | A-08 | 三田 | 港区 |
| Mita | TOEI | Mita line | Minato ward | I-04 | 三田 | 港区 |
| Mitaka | JR East | Sobu-chuo line | Tokyo pref. | 三鷹 | 東京都 | |
| Mitaka | JR East | Chuo line | Tokyo pref. | 三鷹 | 東京都 | |
| Mitaka-dai | KEIO | Inokashira line | Tokyo pref. | IN15 | 三鷹台 | 東京都 |
| Mitake | JR East | Ome line | Tokyo pref. | 御嶽 | 東京都 | |
| Mitsukoshi-mae | Tokyo Metro | Ginza line | Chuo ward | G-12 | 三越前 | 中央区 |
| Mitsukoshi-mae | Tokyo Metro | Hanzomon line | Chuo ward | Z-09 | 三越前 | 中央区 |
| Miura-kaigan | KEIKYU | Kurihama line | Kanagawa pref. | KK71 | 三浦海岸 | 神奈川県 |
| Miyahara | JR East | Takasaki line | Saitama pref. | 宮原 | 埼玉県 | |
| Miyamaedaira | TOKYU | Denen-toshi line | Kanagawa pref. | DT13 | 宮前平 | 神奈川県 |
| Miyano-mae | TOEI | Arakawa line | Arakawa ward | 宮ノ前 | 荒川区 | |
| Miyanohira | JR East | Ome line | Tokyo pref. | 宮ノ平 | 東京都 | |
| Miyanosaka | TOKYU | Setagaya line | Setagaya ward | SG07 | 宮の坂 | 世田谷区 |
| Miyanoshita | Hakone-tozan | Hakone-tozan line | Kanagawa pref. | 宮ノ下 | 神奈川県 | |
| Miyazakidai | TOKYU | Denen-toshi line | Kanagawa pref. | DT12 | 宮崎台 | 神奈川県 |
| Mizono-kuchi | TOKYU | Denen-toshi line | Kanagawa pref. | DT10 | 溝の口 | 神奈川県 |
| Mizonokuchi | TOKYU | Oimachi line | Kanagawa pref. | OM16 | 溝の口 | 神奈川県 |
| Mizue | TOEI | Shinjuku line | Edogawa ward | S-19 | 瑞江 | 江戸川区 |
| Mizuhodai | TOBU | Tojo line | Saitama pref. | TJ-16 | みずほ台 | 埼玉県 |
| Mizusawa-esashi | JR East | Tohoku shinkansen | Iwate pref. | 水沢江刺 | 岩手県 | |
| Mobara | JR East | Sotobo line | Chiba pref. | 茂原 | 千葉県 | |
| Mogusaen | KEIO | Keio line | Tokyo pref. | KO28 | 百草園 | 東京都 |
| Monoi | JR East | Sobu line | Chiba pref. | 物井 | 千葉県 | |
| Monzen-nakamachi | TOEI | Oedo line | Koto ward | E-15 | 門前仲町 | 江東区 |
| Monzen-nakamachi | Tokyo Metro | Tozai line | Koto ward | T-12 | 門前仲町 | 江東区 |
| Morinji-mae | TOBU | Isesaki line | Gunma pref. | TI-09 | 茂林寺前 | 群馬県 |
| Morioka | JR East | Tohoku shinkansen | Iwate pref. | 盛岡 | 岩手県 | |
| Morioka | JR East | Akita shinkansen | Iwate pref. | 盛岡 | 岩手県 | |
| Morishita | TOEI | Oedo line | Koto ward | E-13 | 森下 | 江東区 |
| Morishita | TOEI | Shinjuku line | Koto ward | S-11 | 森下 | 江東区 |
| Moriya | Tsukuba Express | Tsukuba Express line | Ibaraki pref. | 15 | 守谷 | 茨城県 |
| Moto-hasunuma | TOEI | Mita line | Itabashi ward | I-20 | 本蓮沼 | 板橋区 |
| Moto-kaji | SEIBU | Ikebukuro line | Saitama pref. | SI25 | 元加治 | 埼玉県 |
| Moto-kugenuma | ODAKYU | Enoshima line | Kanagawa pref. | 元鵠沼 | 神奈川県 | |
| Moto-sumiyoshi | TOKYU | Toyoko line | Kanagawa pref. | TY12 | 元住吉 | 神奈川県 |
| Moto-sumiyoshi | TOKYU | Meguro line | Kanagawa pref. | MG12 | 元住吉 | 神奈川県 |
| Moto-yawata | JR East | Sobu-chuo line | Chiba pref. | 本八幡 | 千葉県 | |
| Moto-yawata | TOEI | Shinjuku line | Chiba pref. | S-21 | 本八幡 | 千葉県 |
| Motomachi-chukagai | Minato-mirai | Minato-mirai line | Kanagawa pref. | MM06 | 元町・中華街 | 神奈川県 |
| Mukogaoka-yuen | ODAKYU | Odawara line | Kanagawa pref. | 向ヶ丘遊園 | 神奈川県 | |
| Mukouhara | TOEI | Arakawa line | Toshima ward | 向原 | 豊島区 | |
| Murakami | Toyo-kosoku | Toyo-kosoku line | Chiba pref. | 村上 | 千葉県 | |
| Murayama | JR East | Yamagata shinkansen | Yamagata pref. | 村山 | 山形県 | |
| Musashi-fujisawa | SEIBU | Ikebukuro line | Saitama pref. | SI21 | 武蔵藤沢 | 埼玉県 |
| Musashi-hikida | JR East | Itsukaichi line | Tokyo pref. | 武蔵引田 | 東京都 | |
| Musashi-itsukaichi | JR East | Itsukaichi line | Tokyo pref. | 武蔵五日市 | 東京都 | |
| Musashi-koganei | JR East | Chuo line | Tokyo pref. | 武蔵小金井 | 東京都 | |
| Musashi-kosugi | JR East | Shonan-shinjuku line | Kanagawa pref. | 武蔵小杉 | 神奈川県 | |
| Musashi-kosugi | JR East | Yokosuka line | Kanagawa pref. | 武蔵小杉 | 神奈川県 | |
| Musashi-kosugi | TOKYU | Toyoko line | Kanagawa pref. | TY11 | 武蔵小杉 | 神奈川県 |
| Musashi-kosugi | TOKYU | Meguro line | Kanagawa pref. | MG11 | 武蔵小杉 | 神奈川県 |
| Musashi-koyama | TOKYU | Meguro line | Shinagawa ward | MG03 | 武蔵小山 | 品川区 |
| Musashi-masuko | JR East | Itsukaichi line | Tokyo pref. | 武蔵増戸 | 東京都 | |
| Musashi-nitta | TOKYU | Tokyu-tamagawa line | Ota ward | TM05 | 武蔵新田 | 大田区 |
| Musashi-ranzan | TOBU | Tojo line | Saitama pref. | TJ-32 | 武蔵嵐山 | 埼玉県 |
| Musashi-sakai | JR East | Chuo line | Tokyo pref. | 武蔵境 | 東京都 | |
| Musashi-sakai | SEIBU | Tamagawa line | Tokyo pref. | SW01 | 武蔵境 | 東京都 |
| Musashi-seki | SEIBU | Seibu-shinjuku line | Nerima ward | SS14 | 武蔵関 | 練馬区 |
| Musashi-sunakawa | SEIBU | Haijima line | Tokyo pref. | SS34 | 武蔵砂川 | 東京都 |
| Musashi-urawa | JR East | Musashino line | Saitama pref. | 武蔵浦和 | 埼玉県 | |
| Musashi-urawa | JR East | Saikyo line | Saitama pref. | 武蔵浦和 | 埼玉県 | |
| Musashi-yamato | SEIBU | Tamako line | Tokyo pref. | ST06 | 武蔵大和 | 東京都 |
| Musashi-yokote | SEIBU | Seibu-chichibu line | Saitama pref. | SI29 | 武蔵横手 | 埼玉県 |
| Musashino-dai | KEIO | Keio line | Tokyo pref. | KO21 | 武蔵野台 | 東京都 |
| Mutsuai-nichidai-mae | ODAKYU | Enoshima line | Kanagawa pref. | 六会日大前 | 神奈川県 | |
| Mutsuura | KEIKYU | Zushi line | Kanagawa pref. | KK51 | 六浦 | 神奈川県 |
| Myoden | Tokyo Metro | Tozai line | Chiba pref. | T-21 | 妙典 | 千葉県 |
| Myogadani | Tokyo Metro | Marunouchi line | Bunkyo ward | M-23 | 茗荷谷 | 文京区 |
| Myorenji | TOKYU | Toyoko line | Kanagawa pref. | TY17 | 妙蓮寺 | 神奈川県 |
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